醫學真菌學雜志(Medical Mycology Journal)是一本由Japanese Society for Medical Mycology出版的一本Medicine-Infectious Diseases學術刊物，主要報道Medicine-Infectious Diseases相關領域研究成果與實踐。本刊已入選來源期刊，2021-2022年最新版WOS分區等級：Q4，2023年發布的影響因子為1.4，CiteScore指數1.8，SJR指數0.355。本刊非開放獲取期刊。
《醫學真菌學雜志》是一本同行評審的國際期刊，專注于醫學、獸醫學和環境真菌學與疾病相關的基礎和應用研究，以及深入的學術評論。該期刊旨在發表來自世界各地的高質量科學報告，涵蓋的主題包括真菌病原體的系統發育、流行病學和公共衛生真菌學主題、真菌病的診斷和治療新方法（包括臨床試驗和指南）、藥理學和抗真菌藥物敏感性、分類學變化、與人類或動物疾病相關的新或不尋常真菌的描述、真菌感染的免疫學、預防真菌感染的疫苗學、發病機制和毒力，以及致病真菌的分子生物學，包括基因組學、轉錄組學、代謝組學和蛋白質組學。該期刊不再接受病例報告，并且對于展示對致病真菌有抑制活性的天然產物的研究，如果沒有進行化學特性描述和鑒定抑制活性的化合物，則不予接受 。
| 按JIF指標學科分區 | 收錄子集 | 分區 | 排名 | 百分位 |
| 學科：MYCOLOGY | ESCI | Q4 | 30 / 33 |
10.6%
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| 按JCI指標學科分區 | 收錄子集 | 分區 | 排名 | 百分位 |
| 學科：MYCOLOGY | ESCI | Q4 | 28 / 33 |
16.67%
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湯森路透每年出版一本《期刊引用報告》（Journal Citation Reports，簡稱JCR）。JCR對86000多種SCI期刊的影響因子（Impact Factor）等指數加以統計。JCR將收錄期刊分為176個不同學科類別在JCR的Journal Ranking中，主要參考當年IF，最終每個分區的期刊數量是均分的。
| 學科類別 | 分區 | 排名 | 百分位 |
| 大類：Medicine 小類：Infectious Diseases | Q3 | 241 / 344 |
30%
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| 大類：Medicine 小類：Microbiology | Q4 | 155 / 182 |
15%
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CiteScore：該指標由Elsevier于2016年提出，指期刊發表的單篇文章平均被引用次數。CiteScorer的計算方式是：例如，某期刊2022年CiteScore的計算方法是該期刊在2019年、2020年和2021年發表的文章在2022年獲得的被引次數，除以該期刊2019年、2020年和2021發表并收錄于Scopus中的文章數量總和。
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