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適合轉錄組測序的芒果不同組織RNA試劑盒提取方法研究

張宇; 黃國弟; 莫永龍; 龍凌云; 張繼; 唐玉娟 廣西壯族自治區亞熱帶作物研究所; 廣西南寧530001
  • 芒果
  • rna
  • 試劑盒
  • 測序

摘要:為了探尋能夠滿足芒果各組織轉錄組測序要求的高質量RNA提取方法,以‘桂熱芒82號’的葉片、花和果實為材料,從RNA提取質量和產率、瓊脂糖電泳和RT-PCR結果分析、RNA測序質量評價這3個方面,對常用的3種試劑盒的提取效果進行了實驗研究和評價分析。結果表明:以來自于天根生化科技有限公司的DP419試劑盒提取的芒果各組織的RNA質量均較好,提取的RNA產率遠高于其余兩種試劑盒的提取產率;除以美伯生物醫藥技術有限公司的RM103試劑盒提取芒果各組織所得RNA,經瓊脂糖電泳未見有5S條帶出現外,以其余兩種試劑盒提取的芒果各組織的RNA都存在28S、18S、5S條帶且RT-PCR分析結果理想;對以3種試劑盒提取所得的RNA進行完全測序,結果表明,3種試劑盒提取的RNA完全測序都大于98.99%,能滿足RNA-Seq分析的要求。文中綜合上述評判因素分析認為,天根生化科技有限公司的DP419試劑盒是適用于芒果葉片、花和果實RNA提取的最優試劑盒。

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